В 1965 г. в МГУ были открыты две межфакультетские лаборатории — биоорганической химии и математических методов в биологии, которые располагались в специально построенном здании, получившим название «корпус "А"». В 1991 г. они были переименованы в НИИ физико-химической биологии МГУ. В 2001 г. рядом вырос корпус «Б», где уже более 15 лет обучаются студенты нового факультета биоинженерии и биоинформатики. Число студентов факультета и научных сотрудников НИИ примерно одинаково — чуть более 200 человек.